在完成規范的安裝調試后真，雙錐回轉真空干燥機可以投入到正式使用階段，在實際操作中，應遵循以下方式：
    修改設定溫度：按下控溫儀的功能鍵（SET）；PV屏顯示SP字符后，可以利用鍵頭按鈕對設定溫度加以修改（6090與6210型對2及3個儀表應分別設定修改，以下類同）；修改完成后，再按下SET鍵，PV屏顯示ST字符，設定定時時間。若不使用定時功能，則仍然讓ST=0；再按下SET鍵，使PV屏顯示工作室溫度，SV屏顯示新的設定溫度。儀表AT及HEAT燈亮，此時，儀表重新進入加溫的工作狀態；若工作室內雙錐回轉真空干燥機物的濕度較大，產生的水氣會直接影響真空泵的性能。因此，建議在雙錐回轉真空干燥機箱和真空泵間，串入一個“雙錐回轉真空干燥機/過濾器”。也可以讓廠家按照具體需要配備一個外形尺寸為Φ120×300mm，接口外徑Φ16的雙錐回轉真空干燥機。
    當工作室內溫度接近設定溫度時，HEAT燈忽亮忽暗，表示加熱進入PID調節階段，儀表中的測量溫度有時超過設定溫度，有時低于設定溫度，這些都屬于正常現象。當測量溫度接近或等于設定溫度后，再待1h~2h后，工作室進入恒溫狀態，物品進入雙錐回轉真空干燥機階段。
    當物料在雙錐回轉真空干燥機中完成作業后，關上電源，如果加速降溫，則可以打開放氣閥，使真空度達到0，5min后打開箱門。
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